Ботанический сад СПбГУ является подразделение университета, где выращиваются растения, предназначенные в основном для учебного процесса. Коллекции размещаются на улице (открытый грунт) и в оранжереях (закрытый грунт).
Площадь открытого грунта около 1,5 га. Большую часть занимает дендрарий — коллекция деревьев и кустарников. В саду хорошо представлены хвойные деревья — кипарисовики, туи, пихты, ели, можжевельники и тисы Дальнего Востока и Северной Америки. Большое видовое разнообразие деревьев Д. Востока и Кавказа — клены, буки, грабы, амурский бархат, черемуха. Коллекция постепенно пополняется, высажено много сортовых рододендронов и гортензий.
С приходом весны в саду обильно цвету первоцветы — галантусы, хохлатки, сциллы, нарциссы и тюльпаны и прочие эфемероиды.
Несмотря на расположение в центре города, на территории Ботанического сада особый микроклимат и поэтому у нас можно увидеть теплолюбивые южные растения — белую акацию, бобовник (Золотой дождь), корилопсис, аристолохию маньчжурскую, клен дланевидный, сакуру, тюльпанное дерево, багряник (Церцис) и т. д.
В Ботаническом саду большая коллекция декоративных кустарников — розы, чубушники, спиреи, сирени, форзиции, вейгелы, и травянистых многолетников — пионы, флоксы, лилейники, астильбы и многое другое. На экскурсии посетители сада могут увидеть растения местной европейской флоры и флоры Дальнего Востока — папоротники многоножка и полистихум, страусник и щитовники; многочисленные цветковые растения.

В Ботаническом саду разнообразная коллекция субтропических растений. В ее состав входят растения Средиземноморья, Японии и Китая, Чили и Калифорнии, Новой Зеландии и Австралии, а также все голосеменные растения и субтропические папоротники.
Среди растений юго-восточной Азии следует назвать камелии, вечнозеленые дубы, бирючины, криптомерии, бамбуки, азалии и пр. Из южной Америки в оранжерее можно видеть араукарии, кринодендроны, нотофагусы, миртовые, акации.
Много растений из Австралии и Новой Зеландии. Самые характерные — эвкалипт, метросидерос, новозеландский лён, протейные, казуарины, мелалеуки (то, что часто называют австралийским чайным деревом).
Зимой можно полюбоваться цветением стрелитции королевской — растения из Южной Африки.
По традиции, больше всего растений из субтропиков Средиземноморья: маслина, лавр, лавровишня, пробковый дуб, драконовое дерево Канарских островов, миртовые деревья, знаменитая трава акант, плющи и прочее.

В коллекции тропических растений Ботанического сада представлены разные жизненные формы растений, которых нет в наших северных лесах.
Самые узнаваемые из них пальмы. В тропической оранжерее Сада можно увидеть кубинскую королевскую пальму, пальму «рыбий хвост», а также напоминающие пальмы саговники. В коллекции представлены необычные формы растительной жизни: фикус-душитель, фикус-баньян, тропические вьющиеся растения лианы — вьетнамский виноград, аристолохия гигантская, монстеры и филодендроны.
Тропические растения — эпифиты, которые растут на деревьях, прикрепляясь к ним корнями, также широко представлены в оранжереях сада. Мир эпифитов очень разнообразен, среди них есть кактусы-эпифиты, есть родственники ананаса, тилландсия уснеевидная она же испанская борода и, конечно, папоротники — самые древние растения на земле.
Самая большая трава в мире — банан. В тропической оранжерее он вырастает до 8-ми метров, регулярно цветет и плодоносит. Большой интерес у наших посетителей вызывают насекомоядные, плотоядные растения — непентесы, росянки, жирянки, саррацении.